Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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