Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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COL19A1Q14993 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms