Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL4A6Q14031 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL4A6Q14031 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL4A6Q14031 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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