Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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