Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms