Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPM6BQ13491 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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