Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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