Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CBX3Q13185 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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