Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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