Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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