Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNH2Q12809 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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