Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms