Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms