Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms