Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms