Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC6Q03468 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms