Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX3P78415 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX3P78415 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms