Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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