Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms