Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms