Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLE2P56282 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms