Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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