Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIRAP54198 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIRAP54198 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIRAP54198 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms