Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms