Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK8P49336 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms