Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms