Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms