Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms