Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms