Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms