Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms