Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA4P35212 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms