Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP1P29466 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms