Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms