Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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