Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTX3P26022 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTX3P26022 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms