Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms