Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TNNI3P19429 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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