Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF3P18847 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms