Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XBP1P17861 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XBP1P17861 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XBP1P17861 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms