Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms