Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSP16219 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACADSP16219 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACADSP16219 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms