Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms