Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms