Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms