Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MCF2P10911 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCF2P10911 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms