Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms