Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB1P08034 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJB1P08034 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJB1P08034 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms