Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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