Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG7O95352 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms